Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms