Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms