Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms