Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDCA8Q53HL2 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDCA8Q53HL2 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDCA8Q53HL2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDCA8Q53HL2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDCA8Q53HL2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDCA8Q53HL2 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDCA8Q53HL2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDCA8Q53HL2 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDCA8Q53HL2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDCA8Q53HL2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDCA8Q53HL2 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDCA8Q53HL2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDCA8Q53HL2 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CDCA8Q53HL2 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDCA8Q53HL2 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDCA8Q53HL2 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CDCA8Q53HL2 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDCA8Q53HL2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDCA8Q53HL2 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDCA8Q53HL2 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDCA8Q53HL2 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDCA8Q53HL2 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDCA8Q53HL2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDCA8Q53HL2 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDCA8Q53HL2 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDCA8Q53HL2 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDCA8Q53HL2 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDCA8Q53HL2 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDCA8Q53HL2 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CDCA8Q53HL2 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDCA8Q53HL2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDCA8Q53HL2 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDCA8Q53HL2 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDCA8Q53HL2 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CDCA8Q53HL2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDCA8Q53HL2 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDCA8Q53HL2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDCA8Q53HL2 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDCA8Q53HL2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDCA8Q53HL2 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CDCA8Q53HL2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CDCA8Q53HL2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDCA8Q53HL2 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDCA8Q53HL2 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDCA8Q53HL2 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDCA8Q53HL2 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDCA8Q53HL2 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDCA8Q53HL2 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms