Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms