Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms