Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJI4

SLC9B1, Sodium/hydrogen exchanger 9B1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9B1Q4ZJI4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC9B1Q4ZJI4 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms