Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms