Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9J0

TYSND1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYSND1Q2T9J0 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms