Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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