Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDO1Q16878 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
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