Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
UPP1Q16831 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
UPP1Q16831 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
UPP1Q16831 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
UPP1Q16831 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
UPP1Q16831 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
UPP1Q16831 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
UPP1Q16831 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
UPP1Q16831 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
UPP1Q16831 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
UPP1Q16831 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
UPP1Q16831 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
UPP1Q16831 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
UPP1Q16831 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
UPP1Q16831 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
UPP1Q16831 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
UPP1Q16831 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
UPP1Q16831 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
UPP1Q16831 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
UPP1Q16831 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
UPP1Q16831 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
UPP1Q16831 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms