Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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