Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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