Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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