Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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