Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
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