Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms