Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms