Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms