Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
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UBE4AQ14139 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
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