Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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PDE6HQ13956 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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PDE6HQ13956 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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PDE6HQ13956 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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PDE6HQ13956 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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PDE6HQ13956 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
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