Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
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