Protein–RNA interactions for Protein: Q13573

SNW1, SNW domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNW1Q13573 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNW1Q13573 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNW1Q13573 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNW1Q13573 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNW1Q13573 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNW1Q13573 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNW1Q13573 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNW1Q13573 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNW1Q13573 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNW1Q13573 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNW1Q13573 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms