Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
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