Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms