Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms