Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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