Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
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ERCC8Q13216 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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ERCC8Q13216 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
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ERCC8Q13216 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
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ERCC8Q13216 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
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ERCC8Q13216 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
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