Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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GPS1Q13098 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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GPS1Q13098 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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GPS1Q13098 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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GPS1Q13098 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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GPS1Q13098 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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