Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ACACAQ13085 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms