Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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