Protein–RNA interactions for Protein: Q12951

FOXI1, Forkhead box protein I1, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI1Q12951 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXI1Q12951 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms