Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms