Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PDE4DQ08499 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE4DQ08499 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE4DQ08499 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PDE4DQ08499 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE4DQ08499 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE4DQ08499 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE4DQ08499 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE4DQ08499 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE4DQ08499 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE4DQ08499 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms