Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms