Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms