Protein–RNA interactions for Protein: Q04118

PRB3, Basic salivary proline-rich protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB3Q04118 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRB3Q04118 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms