Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC31.56■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC31.53■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC31.51■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC31.5■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms