Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms