Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms