Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRX6P78412 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRX6P78412 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRX6P78412 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
IRX6P78412 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRX6P78412 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
IRX6P78412 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
IRX6P78412 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRX6P78412 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRX6P78412 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRX6P78412 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRX6P78412 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRX6P78412 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
IRX6P78412 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRX6P78412 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRX6P78412 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRX6P78412 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRX6P78412 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
IRX6P78412 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRX6P78412 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRX6P78412 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRX6P78412 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRX6P78412 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRX6P78412 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRX6P78412 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRX6P78412 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRX6P78412 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRX6P78412 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRX6P78412 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRX6P78412 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRX6P78412 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRX6P78412 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRX6P78412 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRX6P78412 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRX6P78412 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRX6P78412 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRX6P78412 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRX6P78412 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRX6P78412 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRX6P78412 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRX6P78412 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRX6P78412 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRX6P78412 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRX6P78412 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRX6P78412 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRX6P78412 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRX6P78412 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRX6P78412 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRX6P78412 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRX6P78412 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
IRX6P78412 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
IRX6P78412 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRX6P78412 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRX6P78412 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRX6P78412 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRX6P78412 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRX6P78412 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRX6P78412 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRX6P78412 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRX6P78412 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRX6P78412 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRX6P78412 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRX6P78412 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRX6P78412 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRX6P78412 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRX6P78412 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRX6P78412 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRX6P78412 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRX6P78412 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRX6P78412 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRX6P78412 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRX6P78412 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRX6P78412 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRX6P78412 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRX6P78412 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRX6P78412 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRX6P78412 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRX6P78412 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRX6P78412 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRX6P78412 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRX6P78412 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRX6P78412 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRX6P78412 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRX6P78412 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRX6P78412 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRX6P78412 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRX6P78412 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRX6P78412 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRX6P78412 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRX6P78412 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRX6P78412 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRX6P78412 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
IRX6P78412 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRX6P78412 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRX6P78412 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRX6P78412 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
IRX6P78412 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRX6P78412 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRX6P78412 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRX6P78412 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms