Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVK-24P63145 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms