Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB1P62873 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB1P62873 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB1P62873 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB1P62873 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB1P62873 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB1P62873 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB1P62873 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB1P62873 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB1P62873 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB1P62873 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB1P62873 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB1P62873 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB1P62873 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB1P62873 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB1P62873 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB1P62873 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB1P62873 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB1P62873 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB1P62873 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB1P62873 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB1P62873 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB1P62873 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB1P62873 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB1P62873 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GNB1P62873 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GNB1P62873 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GNB1P62873 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GNB1P62873 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GNB1P62873 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GNB1P62873 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GNB1P62873 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GNB1P62873 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GNB1P62873 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GNB1P62873 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GNB1P62873 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GNB1P62873 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GNB1P62873 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GNB1P62873 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GNB1P62873 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GNB1P62873 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GNB1P62873 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GNB1P62873 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GNB1P62873 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GNB1P62873 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GNB1P62873 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GNB1P62873 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GNB1P62873 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GNB1P62873 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GNB1P62873 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GNB1P62873 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GNB1P62873 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GNB1P62873 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GNB1P62873 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GNB1P62873 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GNB1P62873 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GNB1P62873 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GNB1P62873 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GNB1P62873 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GNB1P62873 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GNB1P62873 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GNB1P62873 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GNB1P62873 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GNB1P62873 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNB1P62873 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNB1P62873 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNB1P62873 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNB1P62873 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNB1P62873 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNB1P62873 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNB1P62873 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNB1P62873 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNB1P62873 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNB1P62873 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNB1P62873 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNB1P62873 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GNB1P62873 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNB1P62873 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNB1P62873 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNB1P62873 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNB1P62873 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNB1P62873 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNB1P62873 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNB1P62873 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNB1P62873 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNB1P62873 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNB1P62873 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNB1P62873 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GNB1P62873 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNB1P62873 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNB1P62873 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNB1P62873 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNB1P62873 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GNB1P62873 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNB1P62873 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GNB1P62873 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GNB1P62873 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GNB1P62873 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GNB1P62873 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GNB1P62873 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms