Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABCE1P61221 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABCE1P61221 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABCE1P61221 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABCE1P61221 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABCE1P61221 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABCE1P61221 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABCE1P61221 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABCE1P61221 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCE1P61221 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCE1P61221 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCE1P61221 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCE1P61221 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCE1P61221 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCE1P61221 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCE1P61221 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCE1P61221 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCE1P61221 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCE1P61221 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCE1P61221 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCE1P61221 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCE1P61221 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCE1P61221 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCE1P61221 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCE1P61221 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCE1P61221 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCE1P61221 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCE1P61221 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCE1P61221 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCE1P61221 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCE1P61221 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCE1P61221 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCE1P61221 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCE1P61221 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCE1P61221 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCE1P61221 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCE1P61221 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCE1P61221 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCE1P61221 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCE1P61221 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCE1P61221 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCE1P61221 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCE1P61221 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCE1P61221 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCE1P61221 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCE1P61221 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCE1P61221 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCE1P61221 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCE1P61221 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCE1P61221 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCE1P61221 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCE1P61221 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCE1P61221 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCE1P61221 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCE1P61221 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCE1P61221 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCE1P61221 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCE1P61221 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCE1P61221 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCE1P61221 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCE1P61221 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCE1P61221 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCE1P61221 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCE1P61221 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCE1P61221 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms