Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms