Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CABP4P57796 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CABP4P57796 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CABP4P57796 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CABP4P57796 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CABP4P57796 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CABP4P57796 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CABP4P57796 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CABP4P57796 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CABP4P57796 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CABP4P57796 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CABP4P57796 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CABP4P57796 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CABP4P57796 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CABP4P57796 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CABP4P57796 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CABP4P57796 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CABP4P57796 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CABP4P57796 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CABP4P57796 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CABP4P57796 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CABP4P57796 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CABP4P57796 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CABP4P57796 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CABP4P57796 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CABP4P57796 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CABP4P57796 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CABP4P57796 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CABP4P57796 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CABP4P57796 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CABP4P57796 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CABP4P57796 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CABP4P57796 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CABP4P57796 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CABP4P57796 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CABP4P57796 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CABP4P57796 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CABP4P57796 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CABP4P57796 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CABP4P57796 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CABP4P57796 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CABP4P57796 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CABP4P57796 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CABP4P57796 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CABP4P57796 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CABP4P57796 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CABP4P57796 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CABP4P57796 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CABP4P57796 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CABP4P57796 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CABP4P57796 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CABP4P57796 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CABP4P57796 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CABP4P57796 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CABP4P57796 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CABP4P57796 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CABP4P57796 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CABP4P57796 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CABP4P57796 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CABP4P57796 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CABP4P57796 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CABP4P57796 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CABP4P57796 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CABP4P57796 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CABP4P57796 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CABP4P57796 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CABP4P57796 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CABP4P57796 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CABP4P57796 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CABP4P57796 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CABP4P57796 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CABP4P57796 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CABP4P57796 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CABP4P57796 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CABP4P57796 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CABP4P57796 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CABP4P57796 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CABP4P57796 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CABP4P57796 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CABP4P57796 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CABP4P57796 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CABP4P57796 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CABP4P57796 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CABP4P57796 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CABP4P57796 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CABP4P57796 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CABP4P57796 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CABP4P57796 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CABP4P57796 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CABP4P57796 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CABP4P57796 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CABP4P57796 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CABP4P57796 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CABP4P57796 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CABP4P57796 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CABP4P57796 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CABP4P57796 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CABP4P57796 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CABP4P57796 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CABP4P57796 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms