Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB25P57735 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB25P57735 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB25P57735 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB25P57735 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB25P57735 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB25P57735 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB25P57735 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB25P57735 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB25P57735 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB25P57735 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB25P57735 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB25P57735 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB25P57735 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB25P57735 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB25P57735 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB25P57735 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB25P57735 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB25P57735 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB25P57735 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB25P57735 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB25P57735 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB25P57735 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB25P57735 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB25P57735 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB25P57735 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB25P57735 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB25P57735 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB25P57735 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB25P57735 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB25P57735 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB25P57735 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB25P57735 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB25P57735 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB25P57735 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB25P57735 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB25P57735 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB25P57735 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB25P57735 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB25P57735 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB25P57735 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB25P57735 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB25P57735 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB25P57735 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB25P57735 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB25P57735 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB25P57735 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB25P57735 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB25P57735 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB25P57735 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB25P57735 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB25P57735 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB25P57735 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB25P57735 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB25P57735 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB25P57735 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB25P57735 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB25P57735 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB25P57735 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB25P57735 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB25P57735 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB25P57735 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB25P57735 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB25P57735 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB25P57735 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB25P57735 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB25P57735 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB25P57735 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB25P57735 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB25P57735 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB25P57735 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB25P57735 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB25P57735 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB25P57735 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB25P57735 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB25P57735 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB25P57735 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB25P57735 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB25P57735 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB25P57735 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB25P57735 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB25P57735 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB25P57735 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB25P57735 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB25P57735 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB25P57735 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB25P57735 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB25P57735 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB25P57735 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB25P57735 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB25P57735 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB25P57735 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB25P57735 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB25P57735 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB25P57735 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB25P57735 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB25P57735 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB25P57735 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB25P57735 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB25P57735 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms