Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RIPK4P57078 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms