Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms